Zusätzlich zum eigentlichen Programmieren muss ein Entwickler bei großen Projekten den geschriebenen Quelltext auch dokumentieren bzw. kommentieren. Auf diese Weise werden Quelltexte verständlich gehalten und sind für den Autor auch nach ein paar Jahren noch verständlich. Außerdem können sich damit andere Entwickler schneller einlesen.

Um Quelltexte zu dokumentieren gibt es z.B. folgende Tools:

• Doxygen
• javadoc

Um Handbücher zu schreiben empfehlen sich Dateiformate, die sich leicht in eine Versionskontrolle einfügen lassen und deren Kapitel sich über mehrere Dateien verteilen lassen.

• LaTeX

Als Onlinedokumentation empfehlen sich Wikis:

• DokuWiki
• MediaWiki
• MoinMoin